Los avances recientes en biología molecular han incorporado la epigenómica para comprender las interacciones entre el organismo y el ambiente, y la plasticidad fenotípica. Estas respuestas se desarrollan durante la ontogenia e influyen en la reproducción, la respuesta inmunitaria y el crecimiento. La aplicación de la epigenómica es esencial para la selección genética en organismos acuáticos, ya que proporciona una visión integral de los efectos multigeneracionales y hereditarios causados por factores de estrés ambiental como las olas de calor, la hipoxia y la acidificación oceánica. Las herramientas moleculares y bioinformáticas pueden revelar cómo los modificadores epigenómicos inciden en la evolución de las especies acuáticas.
EpiAqua ofrece una excelente oportunidad para estudiantes de posgrado y científicos jóvenes para explorar los últimos avances en epigenómica aplicada. El curso también incluirá tres módulos específicos: un «curso intensivo de genómica», en el que los participantes recibirán capacitación en: (i) herramientas de visualización utilizadas en genómica marina, (ii) análisis de secuenciación de nanoporos e Illumina, y (iii) análisis de microbiota en biología marina. El curso intensivo de genómica se impartirá en el Centro de Biotecnología de la Universidad de Concepción. Durante tres días, expertos de Estados Unidos y de Chile debatirán sobre el potencial de la epigenómica en la acuicultura y sugerirán líneas de investigación futuras para la producción de mariscos y peces.
Dr. Steven Roberts
University of Washington, United States
Dr. Rick Goetz
Profesor Emérito de la University of Wisconsin-Milwaukee
Dr. Cristian Gallardo-Escárate
Centro COPAS Coastal y Centro INCAR2, Universidad de Concepción
El curso se desarrollará en la Universidad de Concepción. En la Facultad de Ciencias Naturales y Oceanográficas
Descripción: Analizar los principales mecanismos epigenéticos —como la metilación del ADN, las modificaciones de histonas y la regulación por ARN no codificantes— y su papel en la respuesta de los organismos acuáticos frente a factores ambientales como el estrés térmico, la hipoxia y la acidificación oceánica.
Descripción: Capacitar a los participantes en el uso de plataformas de secuenciación (Illumina y Nanopore) y de herramientas de análisis computacional aplicadas a la identificación y visualización de marcas epigenéticas y de la variación estructural en genomas marinos.
Descripción: Evaluar cómo los mecanismos epigenómicos influyen en rasgos de interés productivo —como crecimiento, inmunidad y reproducción— y cómo pueden incorporarse en programas de mejoramiento genético multigeneracional.
Descripción: Promover la interacción entre estudiantes de posgrado, investigadores y expertos internacionales para identificar líneas de investigación emergentes y fortalecer la colaboración científica en biología molecular y epigenómica aplicada a la acuicultura sostenible.
Metodología mixta teórico–práctica, basada en aprendizaje activo.
Teórico: clases magistrales breves para alinear conceptos (epigenética, plasticidad, estrés ambiental, aplicaciones en acuicultura).
Práctico: talleres de análisis de datos genómicos/epigenómicos con datasets reales.
Aplicado: discusión de casos de estudio en organismos marinos (peces, moluscos, crustáceos).
Colaborativo: trabajo en pequeños grupos para diseñar una pregunta de investigación en epigenómica acuícola.
Módulo 1: Fundamentos de epigenómica en sistemas acuáticos
Clase expositiva (profesor local/invitado).
Lectura guiada de paper clave (los estudiantes llegan con una ficha de lectura).
Breve cuestionario diagnóstico para nivelar.
Módulo 2: Curso intensivo de genómica (3 subbloques)
Aquí conviene usar instrucciones de laboratorio computacional: cada estudiante trabaja en su notebook/PC con datos proporcionados.
Módulo 3: Epigenómica aplicada a la acuicultura y selección
Seminarios de expertos (EE.UU. y Chile) sobre casos reales.
Discusión dirigida: ¿cómo incorporar señales epigenéticas en programas de mejoramiento y en estudios multigeneracionales?
Módulo 4: Diseño de propuestas de investigación
Grupos de 3–4 estudiantes.
Plantilla entregable: problema → hipótesis → organismo modelo → tipo de estrés (calor, hipoxia, acidificación) → técnica epigenómica → análisis bioinformático → resultado esperado en acuicultura.
Presentación corta al final del curso.
Generalmente es una presentación grupal o individual al término del curso.
Checkpoints prácticos: al terminar cada taller, el estudiante entrega una captura/salida del análisis.
Rúbrica para el mini-proyecto de investigación (claridad de la pregunta, pertinencia de la técnica epigenómica, factibilidad en acuicultura).
Participación en debates con expertos: 1–2 preguntas fundamentadas por grupo.