El Laboratorio de Oceanografía Pesquera y Ecología Larval (LOPEL) cuenta con equipamiento para terreno que incluye equipos para la colección de muestras de plancton (redes tipo Bongo, Tucker Trawl de distintos tamaños y tramas, redes CalVet, redes cónicas con sistema de cierre, etc.), equipos para mediciones de características de la columna de agua (CTD con sensores de oxígeno y fluorescencia Seabird 19 plus y Seabird 25) y sensor multiparámetro de calidad de agua de mar; perfiladores de corrientes (Workhorse, 300 kHz ADCP) con liberador acústico; botellas de muestreo tipo Niskin, contador de cable digital, y materiales para transporte y almacenamiento de muestras vivas desde la embarcación al laboratorio en tierra.

En sus dependencias en la Universidad de Concepción, LOPEL cuenta con equipamiento de laboratorio con material para separación, identificación y experimentación con plancton tales como microscopios binoculares, microscopio óptico con contraste de fases, cámaras fotográficas y de video con conexión a computadores, software analizadores de imágenes (Optimas, Zooimage, Image J), computadores desktop y laptop, impresoras, scanners, conexión internet y biblioteca de ictioplancton especializada; incubadoras y baños termoregulados, columnas de gradientes de densidad, bombas de vacío con su sistemas de filtrado, además de un laboratorio pequeño para análisis bioquímicos básicos equipado con campana de extracción; espectrofotómetro, centrífugas, ultraturrax, baños termoregulados, balanzas digitales y analíticas, desecadores, freezers, termos de nitrógeno líquido, bombonas de gases con sus reguladores.

El departamento de Oceanografía, donde se aloja el LOPEL cuenta además con tres embarcaciones para investigación costera (LC KayKay; LC TenTen; LC SurAustral), además una estación costera de Biologia Marina en Dichato y un laboratorio de investigación costera en la patagonia Chilena (Tortel)